Nad městečkem Cold Rock v U.S.A. se vznáší hrozba: během let odsud beze stopy zmizelo několik dětí. Pověrčiví obyvatelé města hovoří o Tajemném muži, postavě, která si odnáší děti a nikdy je nevrací zpět.
Julia (Jessica Biel) v městečku Cold Rock žije a pracuje jako zdravotní sestra, strašidelnému příběhu ale nevěnuje pozornost. Jedné noci ji přepadne podivný pocit a když se podívá do synova pokojíčku, najde jen prázdnou postel. Rychle seběhne ze schodů a polije ji hrůza: ve dveřích vidí stát Tajemného muže, který v náručí drží jejího syna Davida. Julia se spolehne na svůj mateřský instinkt a pustí se za nimi, chce svého syna získat zpátky, stůj co stůj. Hon začíná a s ním se vrací i dávná otázka: kdo je ten Tajemný muž? Co dělá s unesenými dětmi? Film Tajemný muž navazuje na starší snímky M. Night Shyamalana i na tradici filmů, v nichž hrozí nebezpečí hlavním hrdinkám. Představuje také variaci na téma zpracované ve filmu Úkryt, tentokrát pod širým nebem, a v divákovi při jeho sledování roste stísněný pocit. Tajemný muž totiž na základě lidové pohádky o strašákovi společné všem lidským společenstvím vypráví příběh o neodbytném tajemství, jež se skrývá za každými dveřmi.