Na začátku třetí série je Mulder pohřešován a následně prohlášen za mrtvého… přestože má Scullyová vidinu, podle které je stále naživu. Teď už jsou partneři zpět pohromadě, ale oba se musí vypořádat s dalšími osobními ztrátami. A právě tragédie, které musí přestát, ještě prohloubí jejich vzájemné pouto. To se jim brzy bude hodit. Jejich důvěrně známí nepřátelé se totiž znovu vynořují a některé věci jsou jinak, než se zdály být. Případy, kterými se agenti zabývají, patří zatím mezi nejděsivější a nejzáhadnější!

DISK 1
EPIZODA 1 POŽEHNANÁ CESTA
EPIZODA 2 KANCELÁŘSKÁ SPONA
EPIZODA 3 D.P.O.
EPIZODA 4 POSLEDNÍ ODPOČINEK CLYDEA BRUCKMANA
Bonusy:
Vynechané scény
Mezinárodní klipy

DISK 2
EPIZODA 5 SEZNAM
EPIZODA 6 2SHY
EPIZODA 7 PROCHÁZKA
EPIZODA 8 HLADOMORNA
Bonusy:
Vynechané scény
Mezinárodní klipy

DISK 3
EPIZODA 9 NISEI
EPIZODA 10 731
EPIZODA 11 ZJEVENÍ
EPIZODA 12 VÁLKA COPROPHAGŮ
Bonusy:
Vynechané scény
Mezinárodní klipy

DISK 4
EPIZODA 13 SYZYGIE
EPIZODA 14 GROTESKA
EPIZODA 15 PIPER MARU
EPIZODA 16 APOKRYFY
Bonusy:
Komentáře k epizodě 16
režiséra Kima Mannerse & scénaristy Chrise Cartera
Mezinárodní klipy

DISK 5
EPIZODA 17 PRŮBOJNÝ
EPIZODA 18 TESO DOS BICHOS
EPIZODA 19 PEKELNÉ PENÍZE
EPIZODA 20 JOSE CHUNG “OD JINUD”
Bonusy:
Vynechané scény
Mezinárodní klipy
Komentáře k epizodě 20
režiséra Roba Bowmana & scénaristy Darina Morgana

DISK 6
EPIZODA 21 AVATAR
EPIZODA 22 BAŽINA
EPIZODA 23 MOKRÝ SPOJ
EPIZODA 24 TALITHA CUMI
Bonusy:
Vynechané scény
Mezinárodní klipy

DISK 7
Bonusy:
Dokument: “Pravda o třetí řadě”
Chris Carter hovoří o sezóně 3
Pohledy do zákulisí natáčení
Vynechané scény: 6 částí
Sestřih speciálních efektů
20 Upoutávek